Hội nghị Khảo nghiệm đánh giá rủi ro đối với đa dạng sinh học và môi trường của giống cây trồng biến đổi gen vừa tổ chức mới đây tại Hà Nội của Bộ NN - PTNT được coi là bước quan trọng để công khai hoá việc quản lý một đối tượng cây trồng mới mà cả thế giới đang tranh cãi quyết liệt hai ngả, Mỹ thì ủng hộ, EU lại phản đối kịch liệt. Thậm chí có những nước châu Phi còn hùng hồn tuyên bố: “Chúng tôi thà để cho dân chết đói còn hơn trồng cây biến đổi gen”.
Có lẽ, Việt Nam ở trường phái trung dung, ủng hộ cây trồng biến đổi gen nhưng phải quản lý thật chặt. Thông tư 69 của Bộ NN - PTNT quy định khảo nghiệm đánh giá rủi ro của cây biến đổi gen chính là thể hiện tinh thần đó. Loài cây trồng được phép khảo nghiệm phải nằm trong danh mục loài cây trồng biến đổi gen được phép khảo nghiệm do Bộ trưởng Bộ NN - PTNT ban hành tức chỉ trong phạm vi cây ngô, cây bông vải và cây đậu tương. Tất cả các giống cây trồng biến đổi gen trước khi đưa ra đồng ruộng trồng đều phải khảo nghiệm. Bộ NN & PTNT chỉ cấp giấy phép khảo nghiệm cho giống cây trồng biến đổi gen trên cơ sở kết luận của Hội đồng an toàn sinh học ngành.
Khác với khảo nghiệm giống bình thường, tác giả có thể tự tổ chức được thì khảo nghiệm cây trồng biến đổi gen phải được thực hiện bởi tổ chức khảo nghiệm được công nhận. Nguyên tắc khảo nghiệm được thực hiện theo hai bước, khảo nghiệm hạn chế và khảo nghiệm diện rộng. Khảo nghiệm hạn chế được làm ít nhất trong 2 vụ liên tiếp đối với cây trồng ngắn ngày và 1 chu kỳ sinh trưởng đối với cây trồng dài ngày. Khảo nghiệm diện rộng được thực hiện tối thiểu là 1 vụ đối với cây trồng ngắn ngày và 1 chu kỳ sinh trưởng đối với cây trồng dài ngày.
Khu vực khảo nghiệm phải có biển cảnh báo, hàng rào kiên cố:
Theo PGS Phạm Văn Toản - Vụ Khoa học, công nghệ và môi trường (Bộ NN-PTNT), vì cây trồng biến đổi gen là đối tượng mới nên yêu cầu khảo nghiệm rất chặt chẽ. Nhà lưới, nhà kính sử dụng trong khảo nghiệm phải được thiết kế và xây dựng đảm bảo ngăn chặn sự xâm nhập không được phép từ bên ngoài và sự phát tán giống, vật liệu nhân giống, vật liệu sau thu hoạch của cây trồng biến đổi gen ra ngoài môi trường. Trong khảo nghiệm đồng ruộng, vấn đề được quan tâm nhất là sự thất thoát tự nhiên nên ruộng phải không bị úng ngập đề phòng trôi mất giống, ruộng khảo nghiệm diện hẹp phải có hàng rào bao quanh đảm bảo ngăn ngừa sự xâm nhập trái phép của người và động vật.